長瀬川は，猪苗代湖に流入してくる唯一の河川で，酸性度の高い水質となっている．猪苗代湖が酸性湖であるのもこのためである．
長瀬川は裏磐梯の檜原湖から流れてくるが，裏磐梯から流れてくるときは中性の水質である．途中で安達太良山系から流れて合流する酸川（すかわ）が硫酸酸性の強い水質(Ph.3程度）なため，猪苗代湖に注ぐときには強い酸性となっている．

強い酸性のため，河床の石の色が赤茶色になっている．

長瀬川で水遊びなどをして，白いＴシャツなどに水がつくと，すぐに水のついた部分が赤茶色に変色してしまう．そのくらい酸性度が高い．